Visi Pemerintah Kota Iayapura yaitu “Terwujudnya Kota Jayapura Yang Beriman, Bersatu, Mandiri, Sejahtera dan Modern, Berbasi Kearifan Lokal. Untuk mewujudkan Visi tersebut, maka dirumuskan Misi sebagai berikut :
Berdasarkan Visi dan Misi Walikota Jayapura makan Dinas Perindustrian Perdagangan Koperasi dan UKM Kota Jayapura menitik beratkan kepada Misi ke- 5 yaitu Mengembangan Mengembangkan Potensi Ekonomi Kota Sebagai Kota Jasa, Perdagangan, Pendidikan, Parawisata, dan Untilitas Kota Yang Berwawasan lingkungan.
Dalam rangka mewujudkan Visi dan Misi Pemerintah Kota Jayapura maka tugas pokok dan fungsi Dinas Perindustrian Perdagangan Koperasidan UKM Kota Jayapura adalah menciptakan program dan kegiatan pada OPD yang mendukung perkembangan dan pertumbuhan ekonomi dalam peningkatan kesejahteraan masyarakat di Kota Jayapura.